加尔文坚持认为，教会纪律彰显的不是政治上刀剑的权力，而是属灵的权力。它不是强制性的，而是牧养性质的。毫无疑问，当教会纪律被任意行使时，它就变成了单纯的暴政。但加尔文坚持认为，只有当这个人的行为按着圣经是显而易见犯了罪的、并且只有当他拒绝悔改这种行为时，这个人才须受到惩戒。